Здравствуйте, Алексей!
Коричневое пятно на головке полового члена диаметром 3 мм не причиняющее никаких проблем, не меняющее размеров и не плотное - это скорее всего просто участок пигментированной кожи(в народе - обычная родинка). Я считаю - причины для волнения нет, но если она начнёт Вас беспокоить - сразу же обращайтесь к урологу на очную консультацию.
С уважением, Санжаров А.Е.